Krang libère Miyoko Saki, la mère de Shredder de sa maison de retraite. Shredder menace les gouverments mondiaux et leur dit de se rendre à Krang où il augmentera la chaleur mondiale, ce qui créera une vague de chaleur sans précédent dans New York. Les Tortues bénéficient de l'aide du Colonel Yogurt, un officier de l'air, pour arrêter Shredder qui devient ennuyé par les succès de sa mère.